学校自1909年（清宣统元年）创办始，设立矿务学门，培养造就采矿、冶金和铁路高级专门人才；随后成立了采矿冶金科和土木工程科。沐浴百年风雨，土木学科经受了沧桑巨变。
1921年夏，学校更名福中矿务大学，《福中矿务大学规程》规定本科一、二、三年级开设土木工学课程。
1931年（民国二十年），经教育部批准，学校易名为私立焦作工学院。4月增设土木工程学科，学制四年。当时，本科只有两科四系，即采矿冶金科和土木工程科。土木工程学科包括路工桥梁系和水利系。
1933年，根据教育部规定，改科为系，设置采矿冶金系和土木工程系。
1936年（民国二十五）5月焦作工学院将科改系，设立了采矿、冶金、路工和水利四系。
1937年（民国二十六）抗日战争爆发，焦作工学院先迁西安，再迁天水。1938年7月，教育部决定将焦作工学院与北平大学工学院、北洋工学院、东北大学工学院联合组成国立西北工学院。8月～10月国立西北工学院筹备委员会决定设立八个工程学系，其中土木工程学系由私立焦作工学院、东北大学工学院、北洋工学院土木系合并而成。抗战胜利后，1946年焦作工学院于洛阳复校，改迁郑州、苏州，1949年9月苏州解放后，焦作工学院迁回焦作，更名为国立焦作工学院。1950年3月华北煤矿专科学校并入增设了电机和土木两系。
1951年2月，学院主体迁往天津。主体北迁后，有五分之一的教职工留在焦作，与燃料工业部干部学校、中南煤矿学校（后改名焦作煤矿学校）继续办学。
1958年，重建焦作矿业学院，在焦作矿业学院筹建时，原计划设置采煤、机电两系，煤田开采、矿井建筑、机电三个专业，但根据煤炭生产的需要，矿井建筑没有招生。
1966年开始全国经历“文化大革命”运动，学校基本上处于瘫痪状态，直到1972年焦作矿业学院根据燃料化学工业部和河南省革委的指示，招收“工农兵学员”，时设三系三专业，其中包括采煤系的煤矿建井与开采专业。
1976年后，学校对专业进行了调整，1977年9月，采煤系的煤矿建井与开采专业改为地下开采专业。
1978年，增设煤矿建井专业（矿井建设）。
1994年1月25日，学校为了适应当时煤炭企业和地方经济发展的形势，依托井巷工程教研室、岩土教研室、建筑工程教研室3个教研室，教职员工17人，矿井建设专业、矿井建设专业（矿场地面建筑专门化）、工业与民用建筑专业（专科）3个专业，成立了建筑工程系。
1994年6 月，在矿井建设专业下设交通土建专业方向。
1996年6 月，增设建筑工程专业。
1997年，获工程力学硕士学位授权点。
1999年4月22日，建筑工程系更名为土木建筑工程系。
1999年6 月，为适应国家专业调整的需要，按宽口径的土木工程专业办学，原矿井建设专业、建筑工程专业、交通土建专业等纳入土木工程专业。
2001年，增设工程管理专业。
2002年，增设建筑学专业（2008年移到建筑与艺术设计学院）。
2003年，获岩土工程、供热供燃气通风及空调工程硕士学位授权点。
2003年，增设理论与应用力学专业。
2004年，工程力学学科获省级重点学科，且获重点学科省级特聘教授岗位。
2005年5月19日更名为土木工程学院。
2005年，移设城市规划专业（2008年移到建筑与艺术设计学院）、新增建筑环境与设备工程专业。
2005年，获结构工程、桥梁与隧道工程、防灾减灾工程及防护工程硕士学位授权点。
2006年，获准设置矿山建筑工程博士学位授权学科。
2008年，土木工程学科获一级省重点学科。
2008年，《结构力学》课程入选2008年度国家双语教学示范课程。
2008年，土木工程专业获得省高等学校特色专业建设点建设立项。
2009年，《工程力学》课程入选2009年度省级精品课程。
2009年，土木工程专业入选第四批国家级特色专业建设点。
2009年，新增“建筑与土木工程”工程硕士授权领域。
2009年，新增“固体力学”校级重点学科，建设期2009年-2011年。
2010年，新增“项目管理”工程硕士授权领域；“河南省高等学校深部矿井建设重点学科开放实验室”获河南省教育厅立项建设项目。
2011年，新增土木工程、力学2个一级学科硕士学位授权点；成立了2个院级研究所，分别是：深部巷道支护理论及技术开发研究所；人工环境控制与节能技术研究所。
2012年，新增矿山岩土工程二级学科博士学位授权点，土木工程省级一级重点学科、力学省级二级重点学科通过第七批重点学科验收。获批土木工程和力学2个省级一级重点学科（第八批）；“力学实验教学中心”批准为省级实验教学示范中心。
2013年，增设土木工程本科专业对外合作办学项目；增设城市地下空间工程本科专业。
2014年，土木工程专业入选省级专业综合改革试点专业。
2015年，建筑工程技术专科专业对外合作办学项目停止招生；“生态建筑与环境构建河南省工程实验室”获河南省发改委立项建设。
2016年，“河南省地下空间开发及诱发灾变防治国际联合实验室”获河南省科技厅立项建设。
土木工程学院目前已成为专业设置、师资结构、学科平台、实验设备以及办公条件相对独立的二级教学单位。